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外科手術室：共有22個數位一體化控制無塵手術室，基礎設備配置為Drager、MAQUE等全球第一線品牌。能夠進行心外科所有通科手術，其中經心尖主動脈瓣置換術、微創外科心房顫動治療、微創冠狀動脈旁路移植治療手術量均居全國前列，技術水平達到全國領先水平。
介入手術室：共有13間導管室（包含3間DSA複合手術室）。導管室擁有百級層流潔淨系統、大平板醫用血管造影X線系統、三維血管成像後處理系統、腔內影像學檢查系統、全自動高壓注射系統、Stryker一體化教學視訊轉播系統等。其中經導管主動脈瓣置換術、左心耳封堵術、起搏電極拔除術等多項尖端技術治療量位於全國前列。 DSA複合手術室能讓醫師能藉助全新的複合式手術設施，採用MDT模式，結合介入技術與外科技術的優點，合併治療複雜心血管疾病。